Алещенкова Вероника : другие произведения.

Микобактерии

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    Биоинформационный анализ МБТ vs. другие микроорганизмы


   RpoB gen
  
  
   gcgc
   cggc
   gccg
   gtcg
   gtcggc
   gccgac
   ttct
   aacg
   cgtt
   cgct
   agcg
   Acga
   Tcgt
   tctg
   caga
   Aacc
   Ggtt
   Ttgg
   Ccaa
   Mycobacterium tuberculosis
   27
   45
   49
   43
   9
   7
   5
   9
   11
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   16
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   17
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   3521
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   E.coli K-12
   23
   8
   24
   14
   нет
   2
   13
   31
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   32
   19
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   12
   12
  
   4029
   4029
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      -- S.aureus
   3
   5
   4
   11
   нет
   нет
   13
   19
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   4
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   13
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   17
   17
  
   3552
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   3552
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Rhodococcus erithropolis
   22
   44
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   46
   1
   2
   7
   9
   16
   19
   23
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   12
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   16
   6
   6
  
   3507
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Bifidobacter
   30
   44
   44
   20
   6
   6
   4
   15
   10
   23
   18
   19
   10
   9
   12
   23
   10
   7
   14
  
   3561
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Rhodococcus equi
   37
   51
   44
   46
   5
   5
   6
   9
   10
   26
   24
   29
   21
   6
   11
   14
   10
   3
   9
  
   3507
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   С.diphtheria
   16
   29
   14
   22
   1
   1
   15
   18
   18
   24
   22
   20
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   13
   16
   25
   18
   22
   14
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   C.pseudotuberculosis
   20
   20
   15
   18
   1
   3
   19
   13
   27
   23
   23
   12
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   15
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   11
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   C.jeikeim
   29
   34
   31
   15
   4
   3
   11
   11
   17
   4
   4
   22
   9
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   7
   9
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Rhothia dentocariosa
   24
   24
   25
   11
   1
   no
   8
   8
   15
   23
   20
   17
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   13
   10
   24
   15
   8
   7
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Salmonella typhimurium
   28
   17
   32
   21
   1
   3
   16
   31
   26
   21
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   20
   22
   32
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   26
   6
   9
  
   4039
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Propionibacterium acnes
   21
   22
   32
   39
   5
   7
   9
   11
   20
   17
   18
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   20
   22
   11
  
   3558
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Actinomyces oris
   45
   45
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   34
   2
   6
   3
   13
   no
   22
   23
   24
   19
   6
   5
   12
   no
   1
   19
  
   3522
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
   Streptomyces coelicolor
   37
   55
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   5
   4
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   5
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   Legionella pneumophila
   4
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   3
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   no
   no
   14
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