Слова "мышь" и "муха" действительно происходят от общего корня. Давнего, индоевропейского...
Если кому-то не нравится несоответствие форм в строке "я хожу, а ты летишь", учтите, что мышь ходит, сколько себя помнит, а на муху смотрит непосредственно в момент говорения :)