Никитин Андрей Викторович: другие произведения.

Проблемы понимания системы кодирования Днк

Журнал "Самиздат": [Регистрация] [Найти] [Рейтинги] [Обсуждения] [Новинки] [Обзоры] [Помощь]
Peклaмa:
Peклaмa:


 Ваша оценка:

  Никитин А.В.
  Проблемы понимания системы кодирования ДНК
  
  Да, надо признать, что я оказался неправ. Волнует биологов кодирование информации ДНК. Даже очень. И технократический подход к этой проблеме есть. Может быть не совсем такой, как хотелось мне, но ... есть заинтересованность в нахождении истины. И это главное.
  Петр Петрович Гаряев прислал мне свою последнюю монографию для изучения и понимания, за что ему отдельная благодарность.
  Но, вместе с новой информацией возникли и новые вопросы. О некоторых из них я и попробую рассказать в этой статье.
  
  Два пишем, один - в уме...
  Нечеткое следование триплетам при трансляции белка мы уже отмечали [7]. Тот же вопрос исследует и П.П.Гаряев. Вот фиксируется видимое противоречие:
  
  "Точность кодирования последовательностей аминокислот белков в этой модели странным образом уживается с двойной вырожденностью предлагаемого "кода" по линиям избытка транспортных РНК (тРНК) по сравнению с числом аминокислот и неоднозначного соответствия кодон-антикодон, когда только двум (а не трем) нуклеотидам триплетов иРНК необходимо точное спаривание c антикодоновой парой нуклеотидов тРНК, а по третьему нуклеотиду природой допускается неверное спаривание, так называемое "воблирование" (от англ. слова "wobble"- качание) по гипотезе Ф.Крика [4]. Это означает, что некоторые антикодоны могут "узнавать" более одного кодона в зависимости от того, какое основание находится в 1-м положении антикодона, соответствующем 3-му положению нуклеотида с учетом их антипараллельного комплементарного взаимодействия. "Узнавание" такого рода "неправильное", если следовать парадигме генетического кода, поскольку возникают неканонические пары оснований "Аденин-Гуанин", "Урацил-Цитозин" и другие с энергетически невыгодными водородными связями. "Код", особенно митохондриальный, становится настолько вырожденным, и логически следующий отсюда произвол включения аминокислот в пептидную цепь столь велик, что как бы исчезает само понятие генетического кодирования". [2]
  
  Вопрос поставлен:
  
  "Точность белкового синтеза эволюционно консервативна и высока, но может ли она достигаться такого рода "тайнописью", когда "знак" (кодон) и "обозначаемое" (аминокислота) не всегда изоморфны, не однозначны? Если придерживаться старой догмы генетического кода, логично думать, что две разные аминокислоты, шифруемые двумя одинаковыми (третий не важен) нуклеотидами кодонов иРНК, будут с равной вероятностью включаться в пептидную цепь, т.е. случайно. И таких парных неоднозначностей даже в немитохондриальном коде насчитывается шесть, если не считать еще две по стоповым кодонам (они же "нонсенс" или бессмысленные). Так что же, существует "индульгенция разрешения" частых и случайных замен аминокислот при синтезе белков? Однако, известно, что такие случайные замены в большинстве случаев имеют самые отрицательные последствия для организма (серповидная анемия, талассемии и т.д.). Налицо явное противоречие: нужна точность (однозначность) отношений "знак-обозначаемое" (кодон-аминокислота), а придуманный людьми код ее не обеспечивает". [2]
  Объяснения сути противоречий и предложенного варианта решения:
  
  "Видно, что пары разных аминокислот шифруются одинаковыми значимыми дублетами кодоновых нуклеотидов ("воблирующие" мало значимые, по Крику [4], и вообще нечитаемые, по Лагерквисту [11], нуклеотиды смещены в индекс). В терминах лингвистики это явление носит название омонимия, когда одни и те же слова имеют разный смысл (например, русские слова "лук", "коса" или английские "box", "ring" и т.п.). С другой стороны, избыточные различающиеся кодоны, обозначающие одни и те же аминокислоты, уже давно рассматривают как синонимичные". [4]
  "...Для большей иллюстративности мы приводим таблицу генетического кода, представленную Лагерквистом и перегруппированную им по кодоновым семействам с ориентировкой на первые два рабочих нуклеотида:
   Далее читать на
   http://www.trinitas.ru/rus/doc/0016/001c/00161731.htm
 Ваша оценка:

РЕКЛАМА: популярное на Lit-Era.com  
  А.Гвезда "Нина и лорд" (Попаданцы в другие миры) | | Я.Зыров "Твое дыхание на моих губах" (Любовное фэнтези) | | В.Чернованова "Александрин. Огненный цветок Вальхейма" (Приключенческое фэнтези) | | Л.Свадьбина "Попаданка в академии драконов" (Попаданцы в другие миры) | | У.Михаил "Ездовой Гном -1. Росланд Хай-Тэк" (ЛитРПГ) | | М.Веселая "Я родилась пятидесятилетней... " (Юмористическое фэнтези) | | Р.Ехидна "Мама из другого мира" (Попаданцы в другие миры) | | Д.Вознесенская "Право Ангела." (Любовное фэнтези) | | Е.Истомина "Ман Магическая Академия Наоборот " (Любовная фантастика) | | П.Эдуард " Кваzи Эпсил'on Книга 4. Прародитель." (ЛитРПГ) | |
Связаться с программистом сайта.

Новые книги авторов СИ, вышедшие из печати:
Э.Бланк "Атрион. Влюблен и опасен" Е.Шепельский "Пропаданец" Е.Сафонова "Риджийский гамбит. Интегрировать свет" В.Карелова "Академия Истины" С.Бакшеев "Композитор" А.Медведева "Как не везет попаданкам!" Н.Сапункова "Невеста без места" И.Котова "Королевская кровь. Медвежье солнце"

Как попасть в этoт список
Сайт - "Художники" .. || .. Доска об'явлений "Книги"