Никитин Андрей Викторович: другие произведения.

Проблемы понимания системы кодирования Днк

Журнал "Самиздат": [Регистрация] [Найти] [Рейтинги] [Обсуждения] [Новинки] [Обзоры] [Помощь]
Peклaмa:
Новинки на КНИГОМАН!


Peклaмa:


 Ваша оценка:

  Никитин А.В.
  Проблемы понимания системы кодирования ДНК
  
  Да, надо признать, что я оказался неправ. Волнует биологов кодирование информации ДНК. Даже очень. И технократический подход к этой проблеме есть. Может быть не совсем такой, как хотелось мне, но ... есть заинтересованность в нахождении истины. И это главное.
  Петр Петрович Гаряев прислал мне свою последнюю монографию для изучения и понимания, за что ему отдельная благодарность.
  Но, вместе с новой информацией возникли и новые вопросы. О некоторых из них я и попробую рассказать в этой статье.
  
  Два пишем, один - в уме...
  Нечеткое следование триплетам при трансляции белка мы уже отмечали [7]. Тот же вопрос исследует и П.П.Гаряев. Вот фиксируется видимое противоречие:
  
  "Точность кодирования последовательностей аминокислот белков в этой модели странным образом уживается с двойной вырожденностью предлагаемого "кода" по линиям избытка транспортных РНК (тРНК) по сравнению с числом аминокислот и неоднозначного соответствия кодон-антикодон, когда только двум (а не трем) нуклеотидам триплетов иРНК необходимо точное спаривание c антикодоновой парой нуклеотидов тРНК, а по третьему нуклеотиду природой допускается неверное спаривание, так называемое "воблирование" (от англ. слова "wobble"- качание) по гипотезе Ф.Крика [4]. Это означает, что некоторые антикодоны могут "узнавать" более одного кодона в зависимости от того, какое основание находится в 1-м положении антикодона, соответствующем 3-му положению нуклеотида с учетом их антипараллельного комплементарного взаимодействия. "Узнавание" такого рода "неправильное", если следовать парадигме генетического кода, поскольку возникают неканонические пары оснований "Аденин-Гуанин", "Урацил-Цитозин" и другие с энергетически невыгодными водородными связями. "Код", особенно митохондриальный, становится настолько вырожденным, и логически следующий отсюда произвол включения аминокислот в пептидную цепь столь велик, что как бы исчезает само понятие генетического кодирования". [2]
  
  Вопрос поставлен:
  
  "Точность белкового синтеза эволюционно консервативна и высока, но может ли она достигаться такого рода "тайнописью", когда "знак" (кодон) и "обозначаемое" (аминокислота) не всегда изоморфны, не однозначны? Если придерживаться старой догмы генетического кода, логично думать, что две разные аминокислоты, шифруемые двумя одинаковыми (третий не важен) нуклеотидами кодонов иРНК, будут с равной вероятностью включаться в пептидную цепь, т.е. случайно. И таких парных неоднозначностей даже в немитохондриальном коде насчитывается шесть, если не считать еще две по стоповым кодонам (они же "нонсенс" или бессмысленные). Так что же, существует "индульгенция разрешения" частых и случайных замен аминокислот при синтезе белков? Однако, известно, что такие случайные замены в большинстве случаев имеют самые отрицательные последствия для организма (серповидная анемия, талассемии и т.д.). Налицо явное противоречие: нужна точность (однозначность) отношений "знак-обозначаемое" (кодон-аминокислота), а придуманный людьми код ее не обеспечивает". [2]
  Объяснения сути противоречий и предложенного варианта решения:
  
  "Видно, что пары разных аминокислот шифруются одинаковыми значимыми дублетами кодоновых нуклеотидов ("воблирующие" мало значимые, по Крику [4], и вообще нечитаемые, по Лагерквисту [11], нуклеотиды смещены в индекс). В терминах лингвистики это явление носит название омонимия, когда одни и те же слова имеют разный смысл (например, русские слова "лук", "коса" или английские "box", "ring" и т.п.). С другой стороны, избыточные различающиеся кодоны, обозначающие одни и те же аминокислоты, уже давно рассматривают как синонимичные". [4]
  "...Для большей иллюстративности мы приводим таблицу генетического кода, представленную Лагерквистом и перегруппированную им по кодоновым семействам с ориентировкой на первые два рабочих нуклеотида:
   Далее читать на
   http://www.trinitas.ru/rus/doc/0016/001c/00161731.htm
 Ваша оценка:

РЕКЛАМА: популярное на Lit-Era.com  
  А.Мур "Мой босс - демон!" (Любовное фэнтези) | | С.Волкова "Жена навеки (...и смерть не разлучит нас)" (Любовное фэнтези) | | Д.Сугралинов "Level Up 2. Герой" (ЛитРПГ) | | Д.Рымарь "Диагноз: Срочно замуж" (Современный любовный роман) | | LitaWolf "Неземная любовь" (Любовное фэнтези) | | А.Елисеева "Заложница мага" (Любовное фэнтези) | | Н.Волгина "Провинциалка для сноба" (Современный любовный роман) | | П.Коршунов "Жестокая игра (книга 3) Смерть" (ЛитРПГ) | | С.Волкова "Сердце бабочки" (Любовное фэнтези) | | Д.Коуст "Золушка в поисках доминанта. Остаться собой" (Романтическая проза) | |
Связаться с программистом сайта.

Новые книги авторов СИ, вышедшие из печати:
И.Арьяр "Академия Тьмы и Теней.Советница Его Темнейшества" С.Бакшеев "На линии огня" Г.Гончарова "Тайяна.Влюбиться в небо" Р.Шторм "Академия магических близнецов" В.Кучеренко "Синергия" Н.Нэльте "Слепая совесть" Т.Сотер "Факультет боевой магии.Сложные отношения"

Как попасть в этoт список
Сайт - "Художники" .. || .. Доска об'явлений "Книги"